動植物基因組De novo 測序

     基因組De novo 測序,是指不需要任何參考序列資料即可對某個物種進行測序,用生物信息學分析方法進行拼接、組裝,從而獲得該物種的基因組序列圖譜。利用全基因組從頭測序技術,可以獲得動物、植物、細菌、真菌的全基因組序列,從而推進該物種的研究,在新基因的發現、物種改良等方面發揮巨大作用。

    隨著第二代高通量測序技術的成熟和廣泛應用,基因組測序的成本將會大大降低,測序時間也將進一步大幅縮短,越來越多的實驗室也有能力獨立開展動植物基因組測序項目,大型的動植物基因組測序將不再遙不可及。

    我公司長期從事大型的動植物基因組研究工作,具備每年同時進行多個大型基因組測序和分析的能力。      

一、技術路線:

二、信息學分析
1.原始數據整理、過濾及質量評估
2.基因組序列拼裝與分析
3.功能元件分析

4.定制化分析

 

三、送樣要求:

1.品純度要求: OD值應在1.8至2.0之間;電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整。
2.樣品濃度:濃度不低于200ng/ul;樣品總量不低于500ug。
3.請提供DNA樣品具體濃度、體積、制備時間、溶劑名稱及物種來源。請同時附上QC數據,包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測數據。如需進行多次樣品制備,需要提供多次樣品制備所需樣品。

 

四、成功案例:

木瓜基因組計劃——Papaya Genome Project

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