真菌基因組精細圖

真菌基因組精細圖

     天津生物芯片采用構建不同大小DNA插入片段的測序文庫,進行Illumina 短片段測序和末端配對測序(Mate-Pair,MP)。當測序數據量達到基因組大小的100×以上時,即可保證基因組組裝結果達到精細圖的標準。

一、真菌基因組精細圖

技術路線

 

 

天津生物芯片真菌基因組精細圖技術路線

二、真菌基因組精細圖研究目標
       真菌基因組覆蓋度達到95%以上,基因區覆蓋度達到98% 以上,單堿基的錯誤率達到10萬分之一以內, Scaffold N50大于300kb;進行全基因組精細注釋、基因功能注釋。

三、技術優勢
1、豐富的經驗,基于十余年基因組學研究經驗及強大的生物信息學綜合技術平臺支持,為客戶提供從制定研究計劃到獲得研究成果的全面解決方案。
2、專業的實驗團隊,為實驗結果的真實可靠提供保障。
3、強大的生物信息學分析團隊,我公司擁有一支優秀的生物信息學團隊,團隊中80%的工作人員具有博士學位,長期從事生物信息學分析,實現基本生物信息學分析標準化、流程化,個性化分析定制化,確保高水平的基因組分析結果。
 
四、生物信息學分析內容
1、原始數據進行去除接頭序列及低質量reads處理;
2、數據產出統計及測序數據的成分和質量評估;
3、序列拼接;
4、基因注釋 、基因功能分析 、KEGG通路分析;

5、基因組比較及進化分析,新基因預測;

6、可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。

 

五、真菌基因組精細圖成功案例

1.高山被孢霉(Mortierella alpina)——工業真菌

2.少孢節叢孢(Arthrobotrys oligospora)——捕食線蟲真菌

、實驗周期

從客戶獲得合格樣品后40個工作日內完成文庫構建、上機測序和生物信息學分析工作。
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