細菌基因組完成圖

細菌基因組完成圖

     天津生物芯片擁有自主的PacBio RS II測序平臺,與二代測序平臺相結合,建立了細菌完成圖測序新策略,首推的細菌基因組完成圖測序新策略,進一步縮短了測序周期,最短2周內即可完成基因組測序和生物信息學分析;

適用范圍
1. 普通細菌快速完成圖構建;
2. 尤其適合超高GC/超低GC細菌;
3. 其它用傳統方法測序比較困難菌株;
4. 已完成細菌基因組草圖或精細圖補洞。

 TBC優勢

1、實驗安排靈活、服務周期短、速度快
天津生物芯片擁有自主的PacBio RS II測序平臺可根據合作伙伴具體需要靈活安排實驗。此外,首推的細菌基因組完成圖測序新策略,進一步縮短了測序周期,最短2周內即可完成基因組測序和生物信息學分析;
2、測序結果準確性更高   
細菌基因組完成圖測序的新策略聯合應用了PacBio RS II, Genome Analyzer IIx平臺,結合數十年細菌基因組學研究的經驗累積,多方面保證了拼接結果準確,一致性序列的準確性達99.999%以上,為合作伙伴提供最大程度的質量保障;

測序平臺 單堿基錯誤率 Gap Contig
PacBio RS II平臺      
+ < 十萬分之一 0 1
Genome Analyzer IIx平臺      

3、測序成本更低         
測序新策略降低了測序試劑成本和人工成本,基因組完成圖測序的成本更低,最低僅需4萬元。
 生物信息學分析內容

1、原始數據進行去除接頭序列及低質量reads處理;
2、數據產出統計及測序數據的成分和質量評估;
3、序列拼接;
4、基因注釋 、基因功能分析 、KEGG通路分析;

5、基因組比較及進化分析,新基因預測;

6、可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。

天津生物芯片已完成的項目
自2005年開始至今,天津生物芯片利用不同測序平臺已經完成細菌基因組完成圖測序超過100株,非完成圖測序超過2000株,相關研究成果發表在Nature、PNAS、Genome Biology、Journal of Bacteria等權威期刊發表論文超過120篇。豐富的科研經驗以及全新的測序策略,使天津生物芯片在環境細菌基因組學測序及分析方面處于國內領先地位,可以更好地為合作伙伴的科研項目服務!
 

實驗周期

從客戶獲得合格樣品后60個工作日內完成文庫構建、上機測序和生物信息學分析工作。
  

技術優勢:

(1)豐富的經驗,基于十余年基因組學研究經驗及強大的生物信息學綜合技術平臺支持,為客戶提供從制定研究計劃到獲得研究成果的全面解決方案。

(2)專業的實驗團隊,為實驗結果的真實可靠提供保障。最高的N50組裝指標 ,最少的contig數量 可以達到99.999%準確率 。

(3)強大的生物信息學分析團隊,我公司擁有一支優秀的生物信息學團隊,團隊中80%的工作人員具有博士學位,長期從事生物信息學分析,實現基本生物信息學分析標準化、流程化,個性化分析定制化,確保高水平和低成本的基因組分析結果。

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