基因組光學圖譜

 天津生物芯片于2012年引進國內首臺Argus基因組光學圖譜工作站,并配備了一套用于基因組光學圖譜指導序列拼接的軟件系統。該軟件系統能夠將基因組光學圖譜技術與原始測序數據有效結合,獲得高質量的全基因組序列圖譜。天津生物芯片結合公司已有的微生物圖譜信息庫,利用Argus基因組光學圖譜工作站可以高效、精確地將組裝的基因組序列定位到染色體上,可以完成真菌基因組“完成圖”測序,比較基因組及菌株分型等科研項目。

Argus 基因組光學圖譜工作站
Argus基因組光學圖譜工作站服務領域

"真菌基因組完成圖"測序完美解決方案

 

2012年至今,天津生物芯片技術有限責任公司與南開大學合作建立了基于OpGen公司的Argus系統的基因組光學圖譜工作站,并針對細菌、真菌和動植物進行了基因組光學圖譜(Optical Mapping)分析,并建立了成熟的從樣品處理到結果解析的標準操作流程。
高通量序列拼接結果矯正分析
   隨著測序技術的發展,完成測序的基因組越來越多,但由于基因組自身結構特點(雜合度和重復區等),以及測序技術及拼接原理局限性等原因(讀長和庫長較短),基因組錯拼事件經常發生?;蜃楣庋計準際躋蚱淦唇幼既沸越細弒揮蘭芻蜃櫧唇又柿康?ldquo;金標準”,可以很好地矯正高通量測序拼接結果中的錯誤,特別是由于重復區造成的大尺度的錯拼。

指導序列拼接,顯著增加大型生物基因組序列拼裝質量
   與二代測序技術相結合,利用指導基因組光學圖譜序列拼接的軟件系統,以光學圖譜信息為構建Super-Scaffold,填充Gaps,增加測序覆蓋區域,降低大型生物基因組測序成本,增加基因組拼裝效果。
 大型生物基因組序列拼裝效果

 天津生物真菌研究技術路線

比較基因組及菌株分型
      通過基因組光學圖譜比較,快速地揭示基因組間的相似性和差異性、了解基因組結構變異。
 比較基因組及菌株分型
?   菌株鑒定
     結合天津生物芯片已有的微生物圖譜信息庫,通過圖譜比對,可以將微生物鑒定到菌株水平。

菌株水平 效果圖

更多應用問題請點擊基因組光學圖譜常見問題

天津生物芯片優勢
   2012年引進國內首臺Argus基因組光學圖譜工作站,并配備了一套用于基因組光學圖譜指導序列拼接的軟件系統;
   天津生物芯片技術有限責任公司與南開大學合作,建立了成熟的從樣品處理到結果解析的標準操作流程;
   實驗室從2012年7月引進該平臺至今,已經完成5株真菌和2株植物的基因組光學圖譜分析。
基因組光學圖譜工作原理

 

 

 
 基因組光學圖譜工作原理
 
 
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