Ion torrent 測序

 

 

 

 

 
    Ion Torrent個人化操作基因組測序儀(PGMTM)是基于半導體技術的測序儀。與其他測序技術相比,使用該項技術的測序系統更簡單、更快速、及更易升級。該測序儀與其他高通量測序儀特征互補,可以迅速完成應急服務項目,縮短服務周期,增加服務效率。

 

 

 

    利用Ion Torrent測序平臺,針對擴增子測序、RNA鏈特異性測序、微生物重測序和染色質免疫沉淀測序等服務項目,建立了標準的實驗操作規程,形成了標準化的生物信息學分析流程,針對上述項目已形成從序列破譯到結果解析的完整解決方案。

 

 工作原理:

PGMTM測序儀的核心技術是使用半導體技術在化學和數字信息之間建立直接的聯系。在半導體芯片的微孔中固定DNA鏈,隨后依次摻入ACGT。隨著每個堿基的摻入,釋放出氫離子,在它們穿過每個孔底部時能被檢測到,通過對氫離子的檢測,實時判讀堿基。從而完全擺脫了利用光路系統進行堿基識別的限制,使測序過程更簡單、快捷和低成本。

 

 
 

 

 

技術優勢:

♦ 測序速度快,實驗周期短,從處理樣品到獲得結果只需要不到1天的時間

♦ 適合各種通量需求的測序芯片,可根據實驗測序通量的要求選擇不同的離子半導體芯片,獲得最小10Mb、最大1Gb以上的高準確度序列

♦ 具有良好的測序覆蓋均衡度,可以檢測到以往用其他技術無法檢測的區域,降低獲得最佳結果所需的測序深度

♦ 具有理想的測序讀長,目前測序讀長為400bp

 

主要應用領域:

♦ 擴增子測序
擴增子測序是指利用PCR技術將基因組序列中的某個特定區域擴增出來進行測序,在臨床上有極大的應用。針對PGMTM測序儀,自主研發了擴增子測序高通量序列拼接、比對和分析程序,并與獨有的微生物分子標識數據庫相結合,將能將微生物菌株鑒定到種屬、血清型甚至菌株水平。
♦ RNA單鏈測序
RNA單鏈測序在轉錄組測序分析和small RNA測序分析領域具有重要應用價值,但目前市場上缺少原核生物RNA單鏈測序的試劑盒。結合前期積累的原核生物核糖體RNA消除技術,利用PGMTM測序儀建立了原核生物RNA單鏈測序標準化操作規程,并自主研發了配套的生物信息學分析程序,為原核生物的轉錄組測序和small RNA測序提供平臺和技術基礎。
♦ 基因組及宏基因組測序
與新一代測序相比,PGMTM測序儀具有更好的測序覆蓋均衡度,可以測序獲得新一代測序無法獲得的區域。將PGMTM測序儀與高通量的新一代測序儀(Solexa、Roche 454等)結合使用,可應用于基因組及宏基因組測序領域。

 
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